Distinción, homogeneidad y estabilidad (DHE) mediante caracterización morfológica y molecular en variedades de amaranto

Abstract

Con el objetivo de valorar procedimientos para la evaluación de distinción, homogeneidad y estabilidad en variedades vegetales con fines de protección a los derechos del obtentor, se utilizaron 10 variedades de amaranto. Para el examen de distinción, se aplicó el sistema de agrupamiento del Servicio Nacional de Inspección y Certificación de Semillas, además del Sistema Interanual de Distinción para seis caracteres cuantitativos, destacando que la calificación que se otorga a estos caracteres, no corresponde con los resultados obtenidos aplicando la diferencia mínima significativa. En cuanto a la homogeneidad, todas las plantas de una variedad resultaron muy parecidas entre sí; por otra parte, la estabilidad se evaluó mediante la homogeneidad de los caracteres de las variedades. La caracterización molecular se realizó empleando la técnica de intermicrosatélites. El ADN de las 10 variedades de amaranto se extrajo con el método de CTAB; la amplificación de los fragmentos se hizo mediante la PCR. La similitud genética se estimó mediante el coeficiente de Dice. Los dendrogramas de agrupación de las variedades de amaranto fueron derivados de la matriz de disimilaridad con el algoritmo Sequential Agglomerative Hierarchical Nested Clustering, del sistema de análisis multivariado y taxonómico numérico utilizando el método del promedio aritmético no ponderado por pares (UPGMA). La confiabilidad del dendrograma se probó mediante el método de remuestreo en las matrices de datos con Bootstrapping con 2000 remuestreos. _______________ DISTINCTNESS, UNIFORMITY AND STABILITY (DUS) USING MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR CHARACTERIZATION OF AMARANTH VARIETIES. ABSTRACT: In order to assess the procedures for distinctness, uniformity and stability testing in plant varieties related to breeder's rights protection 10 amaranth varieties were evaluated. For distinctness, the grouping system from the National Service of Seed Inspection and Certification was used along with the Distinctness Inter-annual System for six quantitative characteristics, pointing out that the grade given to the characteristics taken in the field do not correspond to varieties differentiation according to the least significant difference. As for uniformity, all the plants within a variety were very similar to each other; on the other hand, stability was tested trough the uniformity of characters of the varieties. Molecular characterization was carried out using the inter-microsatellite technique. DNA from 10 amaranth varieties was extracted by the CTAB method. Fragments were amplified by PCR. Genetic similarity was estimated using the Dice coefficient. Dendrograms for grouping amaranth varieties were derived from the dissimilarity matrix using the Sequential Agglomerative Hierarchical Nested Clustering algorithm as in the multivariate analysis and numerical taxonomy system, using the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA). Dendrogram reliability was tested by bootstrapping re-sampling method on data matrices with 2000 re- sampling.