Diversidad y estructura genética de Cedrela odorata L. en el estado de Chiapas.

Abstract

Se realizó un análisis de frecuencias alélicas en grupos de árboles (árboles superiores y no superiores) de Cedrela odorata L. en la región norte y sur del estado de Chiapas. Además, se evaluó la diversidad y estructura genética en 63 árboles de cedro en tres regiones de Chiapas. Se colectaron foliolos de hojas jóvenes. La extracción de ADN se llevó a cabo por el método de Saghai-Maroof. Se seleccionaron ocho marcadores SSR para el análisis molecular. En los análisis de árboles superiores y no superiores se encontraron 48 alelos totales. La frecuencia de los 10 alelos más comunes (≥ 0.4) varió de 0.471 a 0.958, el mayor número de ellos en los grupos de árboles no superiores. La diversidad genética en ambos grupos de árboles fue similar, aunque existen diferencias entre regiones [árboles superiores He = 0.718 (norte) y 0.569 (sur) en comparación con los no superiores He = 0.674 (norte) y 0.553 (sur)]. Los grupos presentaron valores positivos en los índices de fijación (Fis = 0.359 y Fit = 0.418), sugiriendo un efecto de endogamia y deficiencia de heterocigotos. El valor promedio de Fst (= 0.091) sugiere que existe diferenciación genética moderada entre los grupos de árboles superiores y los no superiores de las diferentes regiones. El análisis bayesiano identificó tres grupos genéticos de acuerdo a las frecuencias alélicas de los árboles. El Análisis de Coordenadas Principales (PCoA) y el dendrograma identificaron dos grupos genéticos, separando las poblaciones de la región norte y sur. Para los estudios de diversidad genética en las tres regiones, fue ligeramente superior en la región norte (He= 0.724) en comparación con la región centro (He=0.694) y sur (He=0.615). Los valores de índices de fijación también fueron positivos (Fis=0.374 y Fit=0.406). En cuanto a la estructura genética, el valor más alto de Fst fue entre la región norte y sur (0.074), indicando diferenciación genética alta, comparado entre la región norte y centro (0.018). El análisis bayesiano, el PCoA y el dendrograma identificó dos grupos genéticos. El análisis de varianza molecular (AMOVA), sugiere que la mayor variación genética se encuentra dentro de regiones (93.94 %). Los parámetros calculados sugieren que no hay reducción de la diversidad genética al realizar la selección de árboles superiores, al menos para estos marcadores. La región más diversa fue la región norte. _______________ DIVERSITY AND GENETIC STRUCTURE OF Cedrela odorata L. IN THE STATE OF CHIAPAS. ABSTRACT: An allelic frequency analysis was performed on groups of trees (superior and non-superior trees) of Cedrela odorata L. in the northern and southern region of the state of Chiapas. In addition, diversity and genetic structure were evaluated in 63 cedar trees in three regions of Chiapas. Leaflets of young leaves were collected. DNA extraction was carried out by the Saghai-Maroof method. Eight SSR markers were selected for molecular analysis. In the analysis of superior and non-superior trees, 48 total alleles were found. The frequency of the 10 most common alleles (≥ 0.4) varied from 0.471 to 0.958, the largest number of them in non-superior trees. The genetic diversity in both groups of trees was similar, although there are differences between regions [superior trees He = 0.718 (north) and 0.569 (south) compared to the non-superior ones He = 0.674 (north) and 0.553 (south)]. The groups presented positive values in the fixation rates (Fis = 0.359 and Fit = 0.418), suggesting an effect of inbreeding and heterozygous deficiency. The average value of Fst (= 0.091) suggests that there is moderate genetic differentiation between the superior and non-superior tree groups of the different regions. The Bayesian analysis identified three genetic groups according to the allelic frequencies of the trees. The Principal Coordinate Analysis (PCoA) and the dendrogram identified two genetic groups, separating populations from the northern and southern regions. For studies of genetic diversity in the three regions, it was slightly higher in the northern region (He = 0.724) compared to the central region (He = 0.694) and south (He = 0.615). Fixation index values were also positive (Fis = 0.374 and Fit = 0.406). Regarding the genetic structure, the highest Fst value was between the northern and southern regions (0.074), indicating high genetic differentiation, compared between the northern and central regions (0.018). The Bayesian analysis, the PCoA and the dendrogram identified two genetic groups. The analysis of molecular variance (AMOVA) suggests that the greatest genetic variation is found within regions (93.94%). The calculated parameters suggest that there is no reduction in genetic diversity when selecting higher trees, at least for the markers used. The most diverse region was the northern region.