Filogeografía de ocho subespecies de Odocoileus virginianus (Zimmermann, 1780) del Pacífico Mexicano.

Abstract

Odocoileus virginianus es un cérvido emblemático de los ecosistemas de México con interés económico por el sector cinegético. Sorprendentemente, existe conocimiento limitado de la diversidad genética y filogeografía de las subespecies. El objetivo del estudio fue caracterizar la diversidad y estructura genética, las relaciones filogenéticas y genealógicas de ocho subespecies de O. virginianus distribuidas en el Pacífico Mexicano, área donde son escasos los estudios de esta índole. En Unidades de Manejo para la Conservación de la Vida Silvestre (UMA), se recolectó tejido de ocho subespecies de O. virginianus, del cual se extrajo ADN y se secuenció la región D-Loop del ADNmt en 105 muestras. La relación de diversidad haplotípica y nucleotídica de las subespecies indicó recientes cuellos de botella, consistente con los valores negativos de la prueba de Tajima’s D, mientras que la prueba Mismatch distribution evidenció extinción de linajes vía deriva génica. El AMOVA indicó que el 97.1% de la diversidad genética está alojada dentro de subespecies y un 2.9% de la variación genética está dispersa entre subespecies, diferenciando genéticamente a las subespecies (FST= 0.02105, p<0.05), que fue corroborado por la disimilitud del MDS. El filograma de Máxima Parsimonia resolvió como clados monofiléticos a cada subespecie, diferenciando haplogrupos geográficos. La genealogía de genes (red de haplotipos) mostró que O. v. acapulcensis y O. v. couesi son haplotipos ancestrales que originaron haplotipos de O. v. sinaloae. No se detectó un patrón de aislamiento por distancia (Mantel test), esto por el limitado flujo génico entre subespecies. Se concluye que cada subespecie debe considerarse como Unidad Evolutiva Significativa (ESU) y como Unidad de Operativa de Conservación (OCU). _______________ PHYLOGEOGRAPHY OF EIGHT SUBSPECIES OF Odocoileus virginianus (ZIMMERMANN, 1780) OF THE MEXICAN PACIFIC. ABSTRACT: Odocoileus virginianus is a deer emblematic of Mexico ecosystem with economic interest by the hunting sector. Surprisingly, there is a limited understanding of the genetic diversity and phylogeography of subspecies that support management plans. The aim of the study was to characterize the genetic diversity and structure and the phylogenetic and genealogical relationships of eight subspecies of O. virginianus distributed in the Mexican Pacific, area where there have been no studies of this kind. In Management Units for the Conservation of Wildlife, tissue eight subspecies of O. virginianus was collected, from which DNA was extracted and the D-loop region of mtDNA in 105 samples was sequence. The ratio of haplotypic diversity and nucleotidic indicate recent bottlenecks, consistent with the test of neutrality Tajima’s D, while the test "Mismatch distribution" showed the extinction of lineages via genetic drift. AMOVA indicated that over 97% of genetic diversity is housed within subspecies and only 2% of genetic variation is spread between subspecies, resulting genetic differentiation between subspecies (FST= 0.02105, p< 0.05), consistent with the dissimilarity reported by multidimensional scaling analysis. Maximum parsimony phylogram resolved as monophyletic groups each subspecies, differing geographical haplogroups. The genealogy of genes (phylogenetic network) showed that O. v. acapulcensis and O. v. couesi are ancestral haplotypes what originated haplotypes of O. v. sinaloae. A pattern of isolation by distance (Mantel test) was not detected, this for genetic flow limited among subspecies. We conclude that each subspecies should be considered as evolutionarily significant unit (ESU) and operative conservation (OCU) units with strategies particulars of conservation.