Análisis de diversidad genética de Pseudotsuga menziesii.

Abstract

Pseudotsuga menziesii es una conífera altamente valorada en el mundo por su importancia económica y ecológica. Se distribuye de manera natural en Norteamérica, pero se le puede encontrar como una especie exótica en Europa y Sudamérica. Las poblaciones naturales en México están en riesgo de desaparecer debido a que son pequeñas, fragmentadas y con manejo inadecuado. La diversidad y estructura genética en las poblaciones mexicanas ha sido estudiada de manera escasa ya que la mayoría de los reportes existentes, se centran en las de Estados Unidos y Canadá. En el presente estudio se analizaron 13 poblaciones de P. menziesii de la región centro de México con 12 pares de marcadores microsatélites con el objetivo de determinar los niveles de diversidad genética y de inferir su estructura genética. Se detectaron niveles de diversidad genética moderados, se identificaron 73 alelos diferentes, el número promedio de alelos por locus fue de Na=6 heterocigosidad observada de Ho=0.226 y heterocigosidad esperada de Ht=0.417. El coeficiente de diferenciación fue de θ =0.270 y el coeficiente de estructuración de Φst =0.270, sugiriendo una alta diferenciación genética en las poblaciones analizadas. Estos resultados concuerdan con el análisis de varianza molecular que indica que la mayor variación se encuentra dentro de las poblaciones (73.05 %). La prueba de Mantel correlacionó las distancias genéticas con las distancias geográficas, aunque esta correlación no fue significativa. Este resultado sugiere que el aislamiento por distancia no ha impactado en la estructura genética de las poblaciones, aunque existen otros factores ambientales que pueden tener impacto en la misma. Las poblaciones mexicanas mostraron menor diversidad genética en comparación con las reportadas para EE. UU. y Canadá, lo que puede ser resultado de la fragmentación poblacional que limita el flujo génico. El análisis bayesiano de asignación de individuos indicó que el número de grupos genéticos más probable es 2 en las 13 poblaciones. Estos resultados son congruentes con los valores de diversidad genética moderados que deben tomarse en cuenta para el manejo sustentable y conservación de esta conífera. _______________ ANALYSIS OF GENETIC DIVERSITY IN POPULATIONS of Pseudotsuga menziesii (MIRB.) FRANCO USING SSR MARKERS. ABSTRACT: Pseudotsuga menziesii is a conifer highly valued in the world for its economic and ecological importance. It is distributed naturally in North America, but it can be found as an exotic species in Europe and South America. Natural populations in Mexico are at risk of disappearing because they are small, fragmented and with inadequate management. The diversity and genetic structure in Mexican populations have been studied sparingly, with the majority of the existing reports focusing on those populations of the United States and Canada. In the present study, 13 populations of P. menziesii from the central region of Mexico were analyzed with 12 pairs of microsatellite markers in order to determine the levels of genetic diversity and infer their genetic structure. Moderate levels of genetic diversity were detected, 73 different alleles were identified, the average number of alleles per locus was Na = 6 observed heterozygosity of Ho = 0.229 and expected heterozygosity of Ht = 0.417. The differentiation coefficient was θ = 0.270 and the structuring coefficient of Φst = 0.270, suggesting a high genetic differentiation in the analyzed populations. These results agree with the analysis of molecular variance that indicates that the greatest variation is within the populations (73.05%). The Mantel test did correlate the genetic distances with the geographic distances. Albeit, this correlation was not significant, suggesting that isolation by distance has not affected the genetic structure of populations. However, other environmental factors could affect the genetic structure. Mexican populations showed lower genetic diversity values in comparison to those of USA and Canada, which could be the outcome of the limited gene flow among the fragmented populations. The Bayesian analysis of allocation of individuals indicated that the number of genetic groups most likely is two in the 13 analyzed populations. These results are consistent with the values of moderate genetic diversity that should be taken into account for the sustainable management and conservation of this conifer.