Diversidad bacteriana en el tracto digestivo de Eisenia foetida

Abstract

La participación de los microorganismos en el tracto digestivo de la lombriz de tierra es de gran importancia para la transformación de la materia orgánica. El objetivo del presente trabajo fue aislar e identificar mediante métodos bioquímicos y moleculares las especies bacterianas residentes en el tracto digestivo de Eisenia foetida. Las lombrices fueron proporcionadas por el Instituto de Reconversión Productiva y Bioenergética (IRBIO) del Estado de Chiapas y el Colegio de Postgraduados (COLPOS) del Estado de México. Se emplearon 10 ejemplares de cada institución. El tracto digestivo de cada ejemplar fue dividido en tres secciones (A, B y C), de las que se aislaron bacterias en medio de cultivo Infusión Cerebro Corazón (Brain Heart Infusion o BHI). Se aislaron 56 cepas bacterianas de las lombrices de IRBIO y 44 del COLPOS. Se realizó el análisis macroscópico de las cepas bacterianas observándose colonias con elevación convexa; bordes enteros, ondulados y lobulados; color blanco y amarillo; forma circular e irregular y superficies lisas, rugosas y filamentosas. Cuarenta y cuatro de las cepas aisladas fueron Gram negativas y 56 Gram positivas. Para determinar el género y la especie de las bacterias aisladas del contenido intestinal, se realizó la identificación molecular considerando la secuencia de nucleótidos del gen 16S rRNA. Se identificaron nueve géneros en las lombrices provenientes de IRBIO: Bacillus, Paenibacillus, Solibacillus, Staphylococcus, Arthrobacter, Pantoea, Stenotrophomonas, Acinetobacter y Aeromonas, y seis géneros de los especímenes del COLPOS: Bacillus, Paenibacillus, Stenotrophomonas, Staphylococcus, Acinetobacter, Aeromonas. Los géneros Solibacillus sp, y Arthrobacter sp no se encontraron en las lombrices del COLPOS y Staphylococcus warneri no estuvo presente en las lombrices del IRBIO. Se obtuvo mayor aislamiento bacteriano en la sección B, que es la región en la que se encuentra el buche y la molleja, donde el alimento es almacenado. El género Bacillus sp estuvo presente en las tres secciones (A, B y C). Se caracterizaron bioquímicamente las especies bacterianas encontradas en el tracto digestivo de E. foetida, con los sistemas API® 20NE y API 50CHB, reveló su habilidad para asimilar ciertos metabolitos así como su actividad enzimática. El presente trabajo contribuye al conocimiento de la diversidad bacteriana en el tracto digestivo de E. foetida con la idea de mejorar, en un futuro, la biotecnología del vermicompostaje. _______________ BACTERIAL DIVERSITY IN THE DIGESTIVE TRACT OF Eisenia foetida. ABSTRACT: Participation of microorganisms in the digestive tract of the earthworm is of great importance for the transformation of organic matter. The aim of this study was to isolate and identify through biochemical and molecular methods resident bacterial species in the digestive tract of Eisenia fetida. Earthworms were provided by the Institute Productive Restructuring and Bioenergetics (URBIO) the State Chiapas and the Graduate College (COLPOS) the State of Mexico. 10 earthworms of each institution were used. The digestive tract of earthworms was divided into three sections (A, B and C), of which bacteria were isolated in culture medium Brain Heart Infusion (BHI). Were isolated 56 bacterial strains of earthworms IRBIO and 44 the COLPOS. Was performed macroscopic analysis of the bacterial strains was colonies observed with convex elevation; entire margins, wavy and lobed; white and yellow; form circular, irregular and smooth, rough surfaces and filamentous. Forty-four of the isolates were Gram negative and 56 Gram positive. To determine the genus and species of bacteria isolated the intestinal contents, was performed molecular identification considering the nucleotide sequence of 16S rRNA. Nine genus were identified in earthworms from IRBIO: Bacillus, Paenibacillus, Solibacillus, Staphylococcus, Arthrobacter, Pantoea, Stenotrophomonas, Acinetobacter and Aeromonas, and six genus of earthworm of COLPOS: Bacillus, Paenibacillus, Stenotrophomonas, Staphylococcus, Acinetobacter, Aeromonas. Solibacillus sp genus, and Arthrobacter sp were not found in the COLPOS earthworm and Staphylococcus warneri was not present in the earthworm of IRBIO. It was obtained greater bacterial isolation in the section B, which is the region in which the in maw and gizzard, where food is stored. The genus Bacillus sp was present in all three sections (A, B and C). Were characterized biochemically the bacterial species found in the digestive tract of E. foetida, with API® 20NE and API 50CHB systems, revealed his ability to assimilate certain metabolites and enzyme activity. This work contributes to the understanding of bacterial diversity in the gut of E. fetida with the idea of improving in the future biotechnology of vermicomposting.