Etiología, patrón espacio-temporal y análisis filogenético de Armillaria spp, en árboles de durazno [Prunus persica (L) Batsch] en el sur del Estado de México

Abstract

La pudrición de raíces por Armillaria es responsable de la mortalidad significativa de árboles de duraznos en plantaciones del Estado de México, México. En 15 huertas monitoreadas, el promedio en mortalidad de árboles fue 9.7, 15.3 y 20.3% y el área afectada fue 23.2, 24.7 y 28.3% durante 2009, 2010 y 2011, respectivamente. Los portainjertos empleados (‘Nemaguard’ y ‘Criollo de la Goleta’) en la región fueron susceptibles a la enfermedad. Las especies de Armillaria se identificaron mediante la secuenciación de dos regiones de ADN ribosomal (5.8S partial-ITS2-LSU D-dominios y 3' LSU parcial-IGS1) y el gen del factor de elongación-1α (tef-1), las secuencias de ADN se compararon con las especies de Armillaria en el GenBank y se realizaron análisis filogenético. El análisis de 49 aislamientos reveló que cinco (10.2%) tuvieron una relación cercana con A. mellea, ocho (16.3%) con A. gallica y 36 no mostraron similaridad cercana con secuencias de Armillaria en el GenBank; por lo tanto, estos son considerados como una especie no descrita, denominada en esta tesis como A. mexicana. La cual es morfológica y molecularmente diferente de las especies de Armillaria reportadas en América del Norte y Sur. La identificación precisa de las especies de Armillaria en las huertas de durazno de esta región es un primer paso en el desarrollo de prácticas de manejo para esta enfermedad, como portainjertos resistentes. La inoculación artificial con semillas de encino (Quercus sp.) infectadas con A. mexicana (representada por el aislamiento MEX85) y A. mellea (representada por MEX100) en portainjertos establecidos en invernadero y campo, evidenció diferencias en severidad. Esto puede ser atribuido a variación en la patogenicidad y virulencia entre los aislamientos inoculados, también sugiere diferencias en resistencia de los portainjertos evaluados. Ambas especies infectaron a ‘Nemaguard’ y ‘criollos de la Goleta’ (portainjerto regional) en condiciones de invernadero. Durante el periodo de evaluación, la cepa de A. mellea no provocó infección en un ciruelo proveniente de viveros del estado de Veracruz, en ambas condiciones experimentales. El aislamiento de A. mexicana indujo valores altos de severidad en los portainjertos evaluados, siendo los más susceptibles ‘Nemaguard’ y segregantes de Prunus mume._______________ ETIOLOGÍA, PATRÓN ESPACIO-TEMPORAL Y ANÁLISIS FILOGENÉTICO DE Armillaria spp.., EN ÁRBOLES DE DURAZNO [Prunus persica (L.) BATSCH.] EN EL SUR DEL ESTADO DE MÉXICO, MÉXICO. ABSTRACT: Armillaria root disease is causing extensive mortality of peach trees within orchards in the State of Mexico, Mexico. Within 15 monitored orchards, average tree mortality was 9.7, 15.3, and 20.3% and disease-impacted area was 23.2, 24.7, and 28.3% during 2009, 2010, and 2011, respectively. Local rootstocks (‘Nemaguard’ and ‘Criollo of La Goleta’) used in the region were susceptible to the disease. Pathogenic Armillaria spp. were identified by DNA sequencing of two rDNA regions (partial 5.8S-ITS2-LSU D-domains and partial 3' LSU-IGS1) and the translation elongation factor-1α (tef-1) gene, these ADN sequences were compared with Armillaria species on the GenBank accompanied by phylogenetic analyses. Analysis of 49 Armillaria isolates revealed that five isolates (10.2%) were a close match with A. mellea, eight isolates (16.3%) were a close match A. gallica, and 36 isolates (73.5%) showed no close similarity to Armillaria sequences in GenBank; therefore, these are described as a new species named in this thesis as A. mexicana. This species is morphological and phylogenetically distinct from other North and South American Armillaria spp. Accurate identification of Armillaria pathogens in peach orchards is a critical first step toward developing disease management practices, such as resistant rootstock. Artificial inoculation with infected oak (Quercus sp.) acorns with A. mexicana (represented by MEX85) and A. mellea (represented by MEX100) on rootstocks in greenhouse and field conditions showed differences in severity. This may be the result of isolate’s pathogenicity and virulence variations, also suggest differences in resistance among the rootstocks tested. In greenhouse conditions both Armillaria species inoculated infected to ‘Nemaguard’ and ‘Criollo de Goleta’ (a local rootstocks used in the region). During the evaluation period, the A. mellea isolate no induce infection in a plum from Veracruz State. The A. mexicana isolate induced the greatest severity values in all rootstocks tested, but ‘Nemaguard’ and Prunus mume seedlings were more susceptibility than others.