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Title: Nacobbus aberrans en cultivos hortícolas del Centro del Bajío, México : distribución, abundancia y caracterización molecular
Authors: Cabrera Hidalgo, Anselmo de Jesús
VALDOVINOS PONCE, GUADALUPE; 84491
Keywords: N. aberrans
Distribución espacial
Fluensulfone
PCR-RFLPs
Caracterización molecular
Spatial distribution
Molecular characterization
Fitopatología
Doctorado
Issue Date: 2014
Abstract: Nacobbus aberrans es un fitoparásito con una alta capacidad reproductiva y amplia gama de hospedantes, lo que lo convierte en un patógeno importante y de difícil manejo. Presenta una gran variabilidad morfológica y patogénica, y se distribuye ampliamente en las regiones tropicales y templadas del continente Americano, parasitando a más de 84 especies cultivadas y no cultivadas pertenecientes a 18 familias botánicas. Los objetivos de esta investigación fueron analizar su distribución y abundancia en la región central del Bajío mexicano, y su asociación con las características fisicoquímicas del suelo. Adicionalmente, se evaluó su variabilidad genética y el efecto del fluensulfone sobre su movilidad en condiciones in vitro y en invernadero. El nematodo se encontró en seis municipios de la región central del Bajío asociado a los cultivos de calabacita, pepino, chile, tomate y jitomate induciendo agallamientos del 10 al 100%. Los sitios favorables para su distribución presentaron contenido bajo a medio de materia orgánica, proporción de limo del 20-54% y 18-62% de arena, y pH neutro a medianamente alcalino. Las zonas hortícolas evaluadas presentaron diferentes grados de riesgo para la ocurrencia de N. aberrans. La identificación molecular de las poblaciones recolectadas en la región central del Bajío corroboró que dichas poblaciones corresponden a N. aberrans. Los perfiles polimórficos obtenidos después de digerir el fragmento 18S del DNA ribosomal, muestran ligeras diferencias, principalmente con HaeIII. Las características geográficas, ambientales y de la planta hospedante no diferenciaron genéticamente las poblaciones de N. aberrans, ya que todas fueron congregadas en un mismo grupo al analizar las secuencias del gen 18S. Bajo las condiciones evaluadas, el fluensulfone presentó actividad nematicida irreversible sobre juveniles de N. aberrans. La densidad poblacional final, el número de juveniles y el agallamiento en las plantas de jitomate y pepino se redujeron significativamente al tratarlas con fluensulfone y dicloropropeno + cloropicrina. _______________ NACOBBUS ABERRANS IN HORTICULTURAL CROPS IN CENTRAL BAJIO, MEXICO: DISTRIBUTION, ABUNDANCE AND MOLECULAR CHARACTERIZATION. ABSTRACT: Nacobbus aberrans is a phytopathogen organism with a high reproductive capacity and a wide host range that make it an important and difficult pathogen to manage. The nematode has a great morphological and pathogenic variability, and is widely distributed in the tropical and temperate regions of the American Continent, parasitizing more than 84 cultivated and non-cultivated species belonging to 18 botanical families. The objectives of this research were to analyze their distribution and abundance in the central Bajio region of Mexico, and its association with the physicochemical characteristics of the soil. N. aberrans genetic variability and the fluensulfone effects on its behavior under in vitro and greenhouse conditions were evaluated as well. The nematode was found in six counties of the central Bajio region associated with zucchini, cucumber, pepper, tomato and “tomatillo”, inducing a root galling ranging from 10-100%. The most favorable conditions for N. aberrans occurrence where those with a low to medium organic matter content, a 20-54% of lime, 18-62% of sand, and a neutral to moderately alkaline pH. Horticultural areas showed different degrees of risk for the occurrence of N. aberrans. The molecular identification of the 12 populations collected in the central Bajio region confirmed that this nematode is N. aberrans. Polymorphic patterns obtained after the digestion process of the 18S-DNAr fragment showed slight differences, mainly with HaeIII. Geographical, environmental and host plant characteristics do not genetically differentiated among the N. aberrans populations, since all were clustered in the same group after analyzing the sequences of the 18S gene. Under the tested conditions, fluensulfone presented irreversible nematicidal activity on juveniles of N. aberrans. The final population density, the number of juveniles and root galling in tomato and cucumber were significantly reduced when treated with dichloropropene + chloropicrin and fluensulfone.
Description: Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2014.
URI: http://hdl.handle.net/10521/2241
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