Asociación del genoma completo para fecundidad mediante firmas de selección en ovejas de la raza Katahdin.

Abstract

Para lograr que los ovinos lleguen a producir mayor cantidad de crías con menor costo ambiental, se han aplicado biotecnologías reproductivas que mejoran los parámetros reproductivos de las ovejas. Estas biotecnologías van desde la sincronización de estros hasta el uso de información genómica. El análisis de esta última permite el hallazgo de genes candidatos asociados con la reproducción, con el uso de metodologías como firmas de selección. Los objetivos de este documento de tesis fueron: 1) mostrar evidencias de las bases y aplicaciones de la detección de genes candidatos asociados con reproducción en ovejas mediante firmas de selección y, 2) detectar genes candidatos usando firmas de selección en ovejas Katahdin. Para el primer objetivo, se realizó una búsqueda y un análisis de la información científica con base en datos de la Web of Science y Scopus, relacionada con genes candidatos asociados a reproducción en ovinos. Para el segundo objetivo, se usaron registros productivos y reproductivos de tres años, y genotipos (OvineSNP50K) de 48 ovejas Katahdin. Se identificaron dos grupos de ovejas: con alta fecundidad (1.3 ± 0.03) y baja fecundidad (1.1 ± 0.06). Este estudio muestra por primera vez evidencia de la influencia de los genes CNOT11, GLUD1, GRID1, MAPK8 y CCL28 en la fecundidad de ovejas de la raza Katahdin; además, se detectaron nuevos genes candidatos para fecundidad no reportados previamente en ovinos, pero sí para otras especies: ANK2 (cerda), ARHGAP22 (vaca y búfala), GHITM (vaca), HERC6 (vaca), DPF2 (vaca) y TRNAC-GCA (búfala, toro). Finalmente, se necesitan investigaciones futuras enfocadas a describir la base fisiológica de los cambios en el comportamiento reproductivo influido por estos genes. _______________ GENOME-WHOLE ASSOCIATION TO FECUNDITY THROUGH SELECTIVE SIGNATURES IN KATAHDIN SHEEP. ABSTRACT: In order for sheep to produce more offspring at a lower environmental cost, reproductive biotechnologies have been applied that improve the reproductive parameters of sheep. These biotechnologies range from estrus synchronization to the use of genomic information. The analysis of the latter allows the discovery of candidate genes associated with reproduction, with the use of methodologies such as selective signatures. The objectives of this thesis document were: 1) to show evidence of the bases and applications of the detection of candidate genes associated with reproduction in sheep by means of selective signatures and, 2) to detect candidate genes using selective signatures in Katahdin sheep. For the first objective, a search and analysis of scientific information was carried out based on data from the Web of Science and Scopus, related to candidate genes associated with reproduction in sheep. For the second objective, productive and reproductive records of three years, and genotypes (OvineSNP50K) of 48 Katahdin sheep were used. Two groups of sheep were identified: with high fecundity (1.3 ± 0.03) and low fecundity (1.1 ± 0.06). This study shows for the first-time evidence of the influence of the CNOT11, GLUD1, GRID1, MAPK8 and CCL28 genes on the fertility of Katahdin sheep; In addition, new candidate genes for fertility not previously reported in sheep, but for other species were detected: ANK2 (sow), ARHGAP22 (cow and buffalo), GHITM (cow), HERC6 (cow), DPF2 (cow) and TRNAC- GCA (buffalo, bull). Finally, future research is needed to describe the physiological basis of changes in reproductive behaviour influenced by these genes.